Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNA1Q09470 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNA1Q09470 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KCNA1Q09470 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNA1Q09470 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KCNA1Q09470 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
KCNA1Q09470 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNA1Q09470 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA1Q09470 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA1Q09470 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms