Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF4Q08170 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SRSF4Q08170 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF4Q08170 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF4Q08170 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms