Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EGR3Q06889 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EGR3Q06889 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EGR3Q06889 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms