Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TNP2Q05952 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNP2Q05952 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TNP2Q05952 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms