Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A2Q05940 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC18A2Q05940 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC18A2Q05940 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms