Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARID5AQ03989 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARID5AQ03989 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID5AQ03989 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID5AQ03989 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.7 ms