Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNT1Q02742 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCNT1Q02742 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNT1Q02742 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms