Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F1Q01094 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F1Q01094 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F1Q01094 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F1Q01094 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms