Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BEX3Q00994 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
BEX3Q00994 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BEX3Q00994 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BEX3Q00994 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEX3Q00994 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.3 ms