Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIM1P81133 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIM1P81133 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIM1P81133 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIM1P81133 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIM1P81133 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIM1P81133 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SIM1P81133 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIM1P81133 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIM1P81133 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIM1P81133 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIM1P81133 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIM1P81133 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIM1P81133 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIM1P81133 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIM1P81133 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIM1P81133 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIM1P81133 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIM1P81133 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIM1P81133 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIM1P81133 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIM1P81133 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIM1P81133 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIM1P81133 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIM1P81133 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIM1P81133 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIM1P81133 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIM1P81133 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIM1P81133 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIM1P81133 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIM1P81133 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIM1P81133 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIM1P81133 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIM1P81133 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIM1P81133 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIM1P81133 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIM1P81133 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIM1P81133 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIM1P81133 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIM1P81133 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIM1P81133 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIM1P81133 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIM1P81133 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIM1P81133 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIM1P81133 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIM1P81133 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIM1P81133 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIM1P81133 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIM1P81133 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIM1P81133 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIM1P81133 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIM1P81133 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIM1P81133 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIM1P81133 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIM1P81133 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIM1P81133 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIM1P81133 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIM1P81133 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIM1P81133 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIM1P81133 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIM1P81133 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIM1P81133 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIM1P81133 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIM1P81133 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIM1P81133 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIM1P81133 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIM1P81133 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIM1P81133 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIM1P81133 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIM1P81133 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIM1P81133 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIM1P81133 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIM1P81133 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIM1P81133 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIM1P81133 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SIM1P81133 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIM1P81133 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIM1P81133 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIM1P81133 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIM1P81133 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIM1P81133 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIM1P81133 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIM1P81133 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIM1P81133 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIM1P81133 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIM1P81133 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIM1P81133 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIM1P81133 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIM1P81133 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIM1P81133 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIM1P81133 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SIM1P81133 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIM1P81133 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIM1P81133 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIM1P81133 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIM1P81133 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIM1P81133 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIM1P81133 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SIM1P81133 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIM1P81133 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms