Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
UFM1P61960 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UFM1P61960 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UFM1P61960 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UFM1P61960 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UFM1P61960 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UFM1P61960 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UFM1P61960 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UFM1P61960 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UFM1P61960 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UFM1P61960 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UFM1P61960 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UFM1P61960 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UFM1P61960 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UFM1P61960 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UFM1P61960 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UFM1P61960 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UFM1P61960 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UFM1P61960 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UFM1P61960 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UFM1P61960 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UFM1P61960 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UFM1P61960 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UFM1P61960 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UFM1P61960 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UFM1P61960 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UFM1P61960 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UFM1P61960 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UFM1P61960 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UFM1P61960 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UFM1P61960 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UFM1P61960 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UFM1P61960 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UFM1P61960 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UFM1P61960 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFM1P61960 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFM1P61960 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFM1P61960 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFM1P61960 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UFM1P61960 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFM1P61960 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFM1P61960 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFM1P61960 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFM1P61960 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFM1P61960 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFM1P61960 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UFM1P61960 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFM1P61960 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFM1P61960 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFM1P61960 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UFM1P61960 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFM1P61960 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFM1P61960 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UFM1P61960 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFM1P61960 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UFM1P61960 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFM1P61960 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFM1P61960 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFM1P61960 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UFM1P61960 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFM1P61960 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFM1P61960 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFM1P61960 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UFM1P61960 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFM1P61960 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFM1P61960 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UFM1P61960 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
UFM1P61960 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFM1P61960 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFM1P61960 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UFM1P61960 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFM1P61960 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFM1P61960 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UFM1P61960 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UFM1P61960 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFM1P61960 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFM1P61960 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFM1P61960 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFM1P61960 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFM1P61960 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFM1P61960 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UFM1P61960 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFM1P61960 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFM1P61960 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UFM1P61960 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFM1P61960 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFM1P61960 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFM1P61960 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFM1P61960 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFM1P61960 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UFM1P61960 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UFM1P61960 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UFM1P61960 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UFM1P61960 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UFM1P61960 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UFM1P61960 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UFM1P61960 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UFM1P61960 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UFM1P61960 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UFM1P61960 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms