Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMP4BP1P59074 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP4BP1P59074 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHMP4BP1P59074 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHMP4BP1P59074 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHMP4BP1P59074 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms