Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EEFSECP57772 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EEFSECP57772 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EEFSECP57772 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EEFSECP57772 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms