Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ELLP55199 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ELLP55199 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ELLP55199 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ELLP55199 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ELLP55199 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ELLP55199 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ELLP55199 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ELLP55199 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ELLP55199 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ELLP55199 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ELLP55199 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ELLP55199 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ELLP55199 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ELLP55199 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ELLP55199 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ELLP55199 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ELLP55199 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ELLP55199 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ELLP55199 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ELLP55199 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ELLP55199 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ELLP55199 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ELLP55199 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ELLP55199 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ELLP55199 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ELLP55199 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ELLP55199 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ELLP55199 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ELLP55199 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ELLP55199 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ELLP55199 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ELLP55199 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ELLP55199 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ELLP55199 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ELLP55199 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ELLP55199 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ELLP55199 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ELLP55199 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ELLP55199 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ELLP55199 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ELLP55199 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ELLP55199 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ELLP55199 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ELLP55199 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ELLP55199 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ELLP55199 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ELLP55199 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ELLP55199 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ELLP55199 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ELLP55199 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ELLP55199 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ELLP55199 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ELLP55199 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ELLP55199 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ELLP55199 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ELLP55199 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ELLP55199 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ELLP55199 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ELLP55199 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ELLP55199 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ELLP55199 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ELLP55199 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELLP55199 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELLP55199 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELLP55199 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELLP55199 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ELLP55199 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELLP55199 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELLP55199 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELLP55199 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELLP55199 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELLP55199 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELLP55199 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELLP55199 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ELLP55199 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELLP55199 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ELLP55199 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELLP55199 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELLP55199 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELLP55199 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ELLP55199 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELLP55199 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELLP55199 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELLP55199 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ELLP55199 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELLP55199 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELLP55199 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ELLP55199 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELLP55199 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELLP55199 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELLP55199 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELLP55199 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELLP55199 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ELLP55199 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELLP55199 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELLP55199 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ELLP55199 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELLP55199 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ELLP55199 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms