Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGGT1BP53609 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP53609 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PGGT1BP53609 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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