Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSR4P51571 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR4P51571 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR4P51571 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSR4P51571 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR4P51571 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR4P51571 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR4P51571 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR4P51571 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSR4P51571 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR4P51571 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR4P51571 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR4P51571 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSR4P51571 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR4P51571 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR4P51571 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR4P51571 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SSR4P51571 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSR4P51571 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR4P51571 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR4P51571 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR4P51571 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR4P51571 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR4P51571 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR4P51571 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR4P51571 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR4P51571 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSR4P51571 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR4P51571 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR4P51571 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR4P51571 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR4P51571 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSR4P51571 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR4P51571 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR4P51571 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR4P51571 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR4P51571 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSR4P51571 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR4P51571 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR4P51571 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR4P51571 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSR4P51571 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSR4P51571 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR4P51571 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR4P51571 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR4P51571 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR4P51571 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR4P51571 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR4P51571 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSR4P51571 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSR4P51571 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR4P51571 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR4P51571 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR4P51571 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR4P51571 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSR4P51571 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR4P51571 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSR4P51571 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR4P51571 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR4P51571 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR4P51571 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR4P51571 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR4P51571 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR4P51571 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR4P51571 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR4P51571 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR4P51571 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR4P51571 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR4P51571 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR4P51571 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR4P51571 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR4P51571 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR4P51571 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR4P51571 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR4P51571 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR4P51571 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR4P51571 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR4P51571 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR4P51571 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR4P51571 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR4P51571 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR4P51571 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR4P51571 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR4P51571 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR4P51571 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR4P51571 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR4P51571 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR4P51571 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR4P51571 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR4P51571 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR4P51571 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR4P51571 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR4P51571 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSR4P51571 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SSR4P51571 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR4P51571 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR4P51571 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR4P51571 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR4P51571 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR4P51571 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 399.1 ms