Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SELENOPP49908 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SELENOPP49908 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SELENOPP49908 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOPP49908 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms