Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALDH1A3P47895 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALDH1A3P47895 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALDH1A3P47895 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALDH1A3P47895 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ALDH1A3P47895 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms