Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP13P45452 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP13P45452 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP13P45452 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP13P45452 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP13P45452 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP13P45452 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP13P45452 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP13P45452 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP13P45452 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP13P45452 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP13P45452 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP13P45452 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP13P45452 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP13P45452 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP13P45452 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP13P45452 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP13P45452 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP13P45452 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP13P45452 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP13P45452 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP13P45452 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP13P45452 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP13P45452 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP13P45452 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP13P45452 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP13P45452 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP13P45452 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP13P45452 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP13P45452 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP13P45452 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP13P45452 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP13P45452 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP13P45452 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP13P45452 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP13P45452 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP13P45452 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP13P45452 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP13P45452 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP13P45452 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP13P45452 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP13P45452 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP13P45452 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP13P45452 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP13P45452 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP13P45452 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP13P45452 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP13P45452 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP13P45452 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP13P45452 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP13P45452 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP13P45452 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP13P45452 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP13P45452 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP13P45452 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP13P45452 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP13P45452 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP13P45452 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP13P45452 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP13P45452 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP13P45452 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP13P45452 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP13P45452 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MMP13P45452 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP13P45452 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP13P45452 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP13P45452 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP13P45452 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP13P45452 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP13P45452 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP13P45452 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP13P45452 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP13P45452 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP13P45452 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP13P45452 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP13P45452 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP13P45452 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP13P45452 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP13P45452 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP13P45452 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMP13P45452 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP13P45452 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMP13P45452 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP13P45452 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP13P45452 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP13P45452 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP13P45452 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MMP13P45452 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP13P45452 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP13P45452 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP13P45452 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMP13P45452 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP13P45452 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP13P45452 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP13P45452 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP13P45452 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP13P45452 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMP13P45452 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP13P45452 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMP13P45452 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms