Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIA3P42263 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA3P42263 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA3P42263 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA3P42263 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms