Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TXLNAP40222 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TXLNAP40222 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TXLNAP40222 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TXLNAP40222 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms