Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGP37231 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGP37231 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGP37231 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGP37231 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGP37231 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGP37231 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGP37231 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPARGP37231 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPARGP37231 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPARGP37231 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPARGP37231 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPARGP37231 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PPARGP37231 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPARGP37231 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPARGP37231 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPARGP37231 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPARGP37231 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPARGP37231 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGP37231 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGP37231 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGP37231 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGP37231 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGP37231 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPARGP37231 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPARGP37231 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARGP37231 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARGP37231 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARGP37231 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPARGP37231 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARGP37231 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARGP37231 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPARGP37231 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGP37231 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGP37231 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPARGP37231 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARGP37231 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPARGP37231 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPARGP37231 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPARGP37231 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARGP37231 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARGP37231 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARGP37231 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARGP37231 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARGP37231 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPARGP37231 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARGP37231 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARGP37231 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARGP37231 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARGP37231 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPARGP37231 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARGP37231 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARGP37231 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARGP37231 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARGP37231 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPARGP37231 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARGP37231 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARGP37231 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARGP37231 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARGP37231 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPARGP37231 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARGP37231 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARGP37231 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARGP37231 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARGP37231 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARGP37231 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPARGP37231 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARGP37231 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARGP37231 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPARGP37231 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGP37231 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGP37231 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGP37231 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGP37231 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGP37231 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPARGP37231 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARGP37231 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARGP37231 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARGP37231 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPARGP37231 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGP37231 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGP37231 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGP37231 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPARGP37231 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARGP37231 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARGP37231 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARGP37231 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPARGP37231 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGP37231 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGP37231 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGP37231 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGP37231 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGP37231 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGP37231 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPARGP37231 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGP37231 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGP37231 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPARGP37231 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGP37231 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPARGP37231 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms