Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
USP6P35125 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP6P35125 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP6P35125 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP6P35125 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP6P35125 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP6P35125 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP6P35125 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP6P35125 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP6P35125 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP6P35125 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP6P35125 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP6P35125 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP6P35125 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP6P35125 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
USP6P35125 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP6P35125 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
USP6P35125 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP6P35125 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
USP6P35125 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP6P35125 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
USP6P35125 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP6P35125 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP6P35125 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP6P35125 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP6P35125 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP6P35125 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP6P35125 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
USP6P35125 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP6P35125 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP6P35125 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP6P35125 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP6P35125 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP6P35125 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP6P35125 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP6P35125 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP6P35125 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
USP6P35125 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP6P35125 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP6P35125 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP6P35125 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP6P35125 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP6P35125 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
USP6P35125 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
USP6P35125 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
USP6P35125 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP6P35125 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
USP6P35125 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP6P35125 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP6P35125 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP6P35125 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
USP6P35125 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
USP6P35125 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP6P35125 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP6P35125 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP6P35125 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP6P35125 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP6P35125 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
USP6P35125 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP6P35125 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP6P35125 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
USP6P35125 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
USP6P35125 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP6P35125 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP6P35125 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP6P35125 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP6P35125 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
USP6P35125 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP6P35125 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP6P35125 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP6P35125 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP6P35125 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP6P35125 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP6P35125 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
USP6P35125 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP6P35125 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP6P35125 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP6P35125 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP6P35125 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP6P35125 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP6P35125 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP6P35125 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP6P35125 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP6P35125 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP6P35125 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP6P35125 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP6P35125 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP6P35125 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP6P35125 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP6P35125 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP6P35125 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP6P35125 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP6P35125 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP6P35125 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP6P35125 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP6P35125 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP6P35125 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP6P35125 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP6P35125 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP6P35125 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms