Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MCM5P33992 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MCM5P33992 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
MCM5P33992 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCM5P33992 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCM5P33992 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCM5P33992 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM5P33992 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM5P33992 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM5P33992 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM5P33992 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCM5P33992 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCM5P33992 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCM5P33992 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCM5P33992 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCM5P33992 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCM5P33992 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MCM5P33992 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MCM5P33992 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM5P33992 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM5P33992 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM5P33992 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM5P33992 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM5P33992 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM5P33992 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM5P33992 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM5P33992 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM5P33992 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM5P33992 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM5P33992 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM5P33992 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM5P33992 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MCM5P33992 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MCM5P33992 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCM5P33992 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCM5P33992 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCM5P33992 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCM5P33992 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCM5P33992 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCM5P33992 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCM5P33992 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCM5P33992 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCM5P33992 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM5P33992 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM5P33992 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM5P33992 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM5P33992 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCM5P33992 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MCM5P33992 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCM5P33992 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCM5P33992 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCM5P33992 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCM5P33992 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCM5P33992 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCM5P33992 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM5P33992 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM5P33992 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM5P33992 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCM5P33992 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCM5P33992 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCM5P33992 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM5P33992 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM5P33992 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM5P33992 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM5P33992 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCM5P33992 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM5P33992 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM5P33992 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM5P33992 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM5P33992 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM5P33992 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCM5P33992 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MCM5P33992 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCM5P33992 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCM5P33992 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCM5P33992 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM5P33992 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM5P33992 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM5P33992 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM5P33992 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM5P33992 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM5P33992 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM5P33992 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM5P33992 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCM5P33992 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM5P33992 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM5P33992 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM5P33992 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM5P33992 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM5P33992 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM5P33992 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM5P33992 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCM5P33992 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM5P33992 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM5P33992 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM5P33992 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM5P33992 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM5P33992 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCM5P33992 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MCM5P33992 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms