Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCKBRP32239 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCKBRP32239 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCKBRP32239 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCKBRP32239 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms