Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC3AP31941 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3AP31941 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3AP31941 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms