Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GTF2E1P29083 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GTF2E1P29083 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GTF2E1P29083 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GTF2E1P29083 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
GTF2E1P29083 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms