Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2CP28335 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2CP28335 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2CP28335 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2CP28335 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2CP28335 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2CP28335 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR2CP28335 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR2CP28335 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HTR2CP28335 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2CP28335 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2CP28335 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2CP28335 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2CP28335 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2CP28335 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2CP28335 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2CP28335 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2CP28335 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2CP28335 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2CP28335 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2CP28335 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2CP28335 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2CP28335 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR2CP28335 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2CP28335 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2CP28335 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2CP28335 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2CP28335 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2CP28335 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2CP28335 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2CP28335 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2CP28335 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR2CP28335 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2CP28335 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2CP28335 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2CP28335 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2CP28335 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2CP28335 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR2CP28335 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms