Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGFR4P22455 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGFR4P22455 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGFR4P22455 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGFR4P22455 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGFR4P22455 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FGFR4P22455 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FGFR4P22455 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FGFR4P22455 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FGFR4P22455 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGFR4P22455 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGFR4P22455 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGFR4P22455 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGFR4P22455 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FGFR4P22455 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FGFR4P22455 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FGFR4P22455 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FGFR4P22455 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGFR4P22455 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FGFR4P22455 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FGFR4P22455 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FGFR4P22455 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGFR4P22455 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGFR4P22455 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGFR4P22455 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGFR4P22455 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FGFR4P22455 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms