Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYT1P21579 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT1P21579 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT1P21579 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT1P21579 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT1P21579 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT1P21579 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT1P21579 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT1P21579 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYT1P21579 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYT1P21579 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYT1P21579 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYT1P21579 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SYT1P21579 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SYT1P21579 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYT1P21579 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYT1P21579 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYT1P21579 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYT1P21579 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYT1P21579 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYT1P21579 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYT1P21579 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYT1P21579 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYT1P21579 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYT1P21579 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYT1P21579 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYT1P21579 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYT1P21579 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYT1P21579 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYT1P21579 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYT1P21579 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYT1P21579 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYT1P21579 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYT1P21579 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYT1P21579 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYT1P21579 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYT1P21579 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYT1P21579 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYT1P21579 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYT1P21579 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYT1P21579 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYT1P21579 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYT1P21579 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYT1P21579 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYT1P21579 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYT1P21579 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYT1P21579 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYT1P21579 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYT1P21579 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYT1P21579 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYT1P21579 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYT1P21579 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYT1P21579 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYT1P21579 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYT1P21579 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYT1P21579 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYT1P21579 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYT1P21579 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYT1P21579 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYT1P21579 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYT1P21579 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYT1P21579 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYT1P21579 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYT1P21579 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT1P21579 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT1P21579 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT1P21579 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT1P21579 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT1P21579 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT1P21579 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT1P21579 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT1P21579 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT1P21579 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT1P21579 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT1P21579 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT1P21579 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SYT1P21579 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT1P21579 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT1P21579 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT1P21579 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT1P21579 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT1P21579 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT1P21579 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT1P21579 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT1P21579 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT1P21579 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT1P21579 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT1P21579 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT1P21579 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT1P21579 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT1P21579 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT1P21579 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT1P21579 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT1P21579 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT1P21579 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT1P21579 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYT1P21579 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYT1P21579 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYT1P21579 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYT1P21579 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms