Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2EP19388 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2EP19388 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2EP19388 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2EP19388 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2EP19388 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms