Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTRB1P17538 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTRB1P17538 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTRB1P17538 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTRB1P17538 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms