Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB42P16452 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB42P16452 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB42P16452 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB42P16452 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB42P16452 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB42P16452 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB42P16452 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB42P16452 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB42P16452 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB42P16452 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB42P16452 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPB42P16452 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB42P16452 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB42P16452 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB42P16452 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB42P16452 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB42P16452 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB42P16452 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB42P16452 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB42P16452 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB42P16452 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB42P16452 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB42P16452 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB42P16452 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB42P16452 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB42P16452 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB42P16452 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB42P16452 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB42P16452 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB42P16452 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB42P16452 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB42P16452 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
EPB42P16452 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB42P16452 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB42P16452 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB42P16452 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB42P16452 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB42P16452 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB42P16452 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB42P16452 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB42P16452 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB42P16452 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB42P16452 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB42P16452 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB42P16452 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB42P16452 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB42P16452 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB42P16452 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB42P16452 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB42P16452 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB42P16452 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB42P16452 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB42P16452 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB42P16452 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB42P16452 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB42P16452 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPB42P16452 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB42P16452 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB42P16452 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB42P16452 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB42P16452 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPB42P16452 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB42P16452 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB42P16452 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB42P16452 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB42P16452 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB42P16452 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPB42P16452 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB42P16452 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB42P16452 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB42P16452 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB42P16452 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPB42P16452 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB42P16452 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB42P16452 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB42P16452 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB42P16452 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPB42P16452 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms