Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMP1P11279 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP1P11279 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP1P11279 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP1P11279 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms