Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP2CP0DJJ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP2CP0DJJ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRGAP2CP0DJJ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2CP0DJJ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms