Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC159P0C7I6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC159P0C7I6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC159P0C7I6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 631 ms