Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGAVP06756 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAVP06756 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAVP06756 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms