Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGRP06401 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGRP06401 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGRP06401 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGRP06401 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGRP06401 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGRP06401 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGRP06401 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGRP06401 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PGRP06401 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGRP06401 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGRP06401 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PGRP06401 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGRP06401 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGRP06401 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGRP06401 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PGRP06401 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGRP06401 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGRP06401 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGRP06401 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGRP06401 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PGRP06401 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGRP06401 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PGRP06401 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGRP06401 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGRP06401 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGRP06401 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGRP06401 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGRP06401 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGRP06401 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGRP06401 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGRP06401 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGRP06401 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGRP06401 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGRP06401 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGRP06401 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGRP06401 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGRP06401 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGRP06401 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGRP06401 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGRP06401 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGRP06401 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGRP06401 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGRP06401 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGRP06401 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGRP06401 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGRP06401 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGRP06401 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PGRP06401 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGRP06401 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGRP06401 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGRP06401 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGRP06401 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGRP06401 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGRP06401 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGRP06401 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGRP06401 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGRP06401 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PGRP06401 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGRP06401 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGRP06401 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGRP06401 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGRP06401 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGRP06401 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGRP06401 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGRP06401 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGRP06401 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGRP06401 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGRP06401 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGRP06401 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGRP06401 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGRP06401 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGRP06401 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGRP06401 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGRP06401 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PGRP06401 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGRP06401 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGRP06401 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PGRP06401 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGRP06401 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGRP06401 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGRP06401 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PGRP06401 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGRP06401 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PGRP06401 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGRP06401 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGRP06401 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGRP06401 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGRP06401 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGRP06401 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGRP06401 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGRP06401 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGRP06401 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGRP06401 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGRP06401 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGRP06401 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGRP06401 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PGRP06401 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGRP06401 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGRP06401 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1642.5 ms