Protein–RNA interactions for Protein: P04196

HRG, Histidine-rich glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRGP04196 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HRGP04196 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HRGP04196 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HRGP04196 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HRGP04196 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HRGP04196 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HRGP04196 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HRGP04196 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HRGP04196 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HRGP04196 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HRGP04196 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HRGP04196 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HRGP04196 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HRGP04196 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HRGP04196 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HRGP04196 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HRGP04196 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HRGP04196 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HRGP04196 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HRGP04196 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HRGP04196 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HRGP04196 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HRGP04196 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HRGP04196 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HRGP04196 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HRGP04196 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HRGP04196 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HRGP04196 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HRGP04196 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HRGP04196 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HRGP04196 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HRGP04196 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HRGP04196 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HRGP04196 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HRGP04196 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HRGP04196 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HRGP04196 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HRGP04196 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HRGP04196 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HRGP04196 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HRGP04196 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HRGP04196 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HRGP04196 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HRGP04196 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HRGP04196 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HRGP04196 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HRGP04196 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HRGP04196 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRGP04196 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRGP04196 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HRGP04196 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HRGP04196 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRGP04196 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRGP04196 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRGP04196 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HRGP04196 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRGP04196 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRGP04196 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRGP04196 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRGP04196 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRGP04196 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRGP04196 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HRGP04196 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HRGP04196 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRGP04196 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRGP04196 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRGP04196 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRGP04196 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRGP04196 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRGP04196 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRGP04196 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRGP04196 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HRGP04196 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRGP04196 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRGP04196 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRGP04196 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRGP04196 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRGP04196 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRGP04196 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRGP04196 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRGP04196 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRGP04196 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRGP04196 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRGP04196 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRGP04196 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRGP04196 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRGP04196 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRGP04196 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRGP04196 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRGP04196 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRGP04196 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRGP04196 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRGP04196 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRGP04196 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HRGP04196 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HRGP04196 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HRGP04196 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRGP04196 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRGP04196 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRGP04196 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms