Protein–RNA interactions for Protein: P01877

IGHA2, Immunoglobulin heavy constant alpha 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA2P01877 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHA2P01877 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHA2P01877 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHA2P01877 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHA2P01877 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHA2P01877 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGHA2P01877 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGHA2P01877 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHA2P01877 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGHA2P01877 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGHA2P01877 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHA2P01877 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.2 ms