Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT4O95628 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT4O95628 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNOT4O95628 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNOT4O95628 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNOT4O95628 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNOT4O95628 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNOT4O95628 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNOT4O95628 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNOT4O95628 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNOT4O95628 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNOT4O95628 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNOT4O95628 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.7 ms