Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCNT3O95395 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GCNT3O95395 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GCNT3O95395 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCNT3O95395 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GCNT3O95395 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GCNT3O95395 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GCNT3O95395 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GCNT3O95395 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCNT3O95395 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCNT3O95395 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCNT3O95395 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCNT3O95395 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GCNT3O95395 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCNT3O95395 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCNT3O95395 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GCNT3O95395 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GCNT3O95395 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GCNT3O95395 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCNT3O95395 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCNT3O95395 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCNT3O95395 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GCNT3O95395 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GCNT3O95395 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GCNT3O95395 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GCNT3O95395 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GCNT3O95395 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GCNT3O95395 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCNT3O95395 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GCNT3O95395 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GCNT3O95395 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCNT3O95395 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCNT3O95395 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCNT3O95395 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCNT3O95395 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCNT3O95395 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GCNT3O95395 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms