Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRATO95237 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRATO95237 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRATO95237 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRATO95237 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRATO95237 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRATO95237 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRATO95237 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRATO95237 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRATO95237 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRATO95237 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRATO95237 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRATO95237 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRATO95237 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRATO95237 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRATO95237 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRATO95237 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRATO95237 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRATO95237 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRATO95237 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRATO95237 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRATO95237 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRATO95237 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRATO95237 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRATO95237 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRATO95237 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRATO95237 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRATO95237 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRATO95237 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRATO95237 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRATO95237 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRATO95237 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRATO95237 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRATO95237 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRATO95237 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRATO95237 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRATO95237 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRATO95237 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRATO95237 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRATO95237 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRATO95237 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRATO95237 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRATO95237 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRATO95237 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRATO95237 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRATO95237 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRATO95237 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRATO95237 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRATO95237 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRATO95237 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRATO95237 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRATO95237 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRATO95237 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRATO95237 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRATO95237 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRATO95237 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRATO95237 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRATO95237 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRATO95237 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRATO95237 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRATO95237 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRATO95237 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRATO95237 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRATO95237 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRATO95237 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRATO95237 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRATO95237 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRATO95237 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRATO95237 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRATO95237 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRATO95237 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRATO95237 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRATO95237 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRATO95237 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRATO95237 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRATO95237 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRATO95237 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRATO95237 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRATO95237 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRATO95237 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRATO95237 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRATO95237 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRATO95237 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRATO95237 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRATO95237 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRATO95237 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRATO95237 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRATO95237 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRATO95237 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRATO95237 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRATO95237 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRATO95237 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRATO95237 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRATO95237 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRATO95237 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRATO95237 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRATO95237 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRATO95237 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRATO95237 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRATO95237 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.7 ms