Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24DO94855 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24DO94855 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24DO94855 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms