Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIN3BO75182 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIN3BO75182 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SIN3BO75182 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIN3BO75182 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms