Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX2O60749 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX2O60749 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX2O60749 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX2O60749 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX2O60749 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX2O60749 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX2O60749 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX2O60749 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX2O60749 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX2O60749 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX2O60749 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX2O60749 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX2O60749 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX2O60749 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX2O60749 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX2O60749 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX2O60749 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX2O60749 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX2O60749 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX2O60749 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX2O60749 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX2O60749 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX2O60749 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX2O60749 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX2O60749 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX2O60749 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX2O60749 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX2O60749 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX2O60749 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX2O60749 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX2O60749 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX2O60749 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX2O60749 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX2O60749 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX2O60749 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX2O60749 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX2O60749 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX2O60749 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX2O60749 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX2O60749 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX2O60749 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX2O60749 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX2O60749 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX2O60749 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX2O60749 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX2O60749 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX2O60749 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX2O60749 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX2O60749 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX2O60749 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX2O60749 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX2O60749 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX2O60749 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX2O60749 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX2O60749 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX2O60749 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX2O60749 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX2O60749 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX2O60749 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX2O60749 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX2O60749 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX2O60749 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX2O60749 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX2O60749 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX2O60749 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX2O60749 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX2O60749 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX2O60749 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX2O60749 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX2O60749 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX2O60749 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX2O60749 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX2O60749 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX2O60749 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX2O60749 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX2O60749 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX2O60749 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX2O60749 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX2O60749 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX2O60749 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX2O60749 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX2O60749 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX2O60749 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX2O60749 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX2O60749 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX2O60749 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX2O60749 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX2O60749 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX2O60749 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX2O60749 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX2O60749 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX2O60749 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX2O60749 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX2O60749 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX2O60749 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX2O60749 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX2O60749 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX2O60749 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX2O60749 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms