Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOFO60613 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOFO60613 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SELENOFO60613 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms