Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAK2O60296 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAK2O60296 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK2O60296 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAK2O60296 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms