Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTIFO43310 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTIFO43310 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTIFO43310 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTIFO43310 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTIFO43310 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTIFO43310 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTIFO43310 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTIFO43310 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTIFO43310 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTIFO43310 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTIFO43310 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTIFO43310 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTIFO43310 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTIFO43310 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTIFO43310 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTIFO43310 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTIFO43310 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTIFO43310 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTIFO43310 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTIFO43310 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTIFO43310 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTIFO43310 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTIFO43310 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTIFO43310 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTIFO43310 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTIFO43310 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTIFO43310 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTIFO43310 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTIFO43310 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTIFO43310 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTIFO43310 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTIFO43310 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTIFO43310 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTIFO43310 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTIFO43310 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTIFO43310 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTIFO43310 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTIFO43310 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTIFO43310 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTIFO43310 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTIFO43310 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTIFO43310 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTIFO43310 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTIFO43310 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTIFO43310 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTIFO43310 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTIFO43310 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTIFO43310 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTIFO43310 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTIFO43310 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTIFO43310 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTIFO43310 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTIFO43310 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTIFO43310 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTIFO43310 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTIFO43310 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTIFO43310 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTIFO43310 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTIFO43310 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTIFO43310 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTIFO43310 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTIFO43310 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTIFO43310 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTIFO43310 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTIFO43310 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTIFO43310 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CTIFO43310 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTIFO43310 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTIFO43310 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTIFO43310 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CTIFO43310 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTIFO43310 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTIFO43310 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CTIFO43310 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTIFO43310 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTIFO43310 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CTIFO43310 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTIFO43310 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTIFO43310 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTIFO43310 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTIFO43310 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTIFO43310 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTIFO43310 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTIFO43310 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTIFO43310 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTIFO43310 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTIFO43310 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTIFO43310 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTIFO43310 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTIFO43310 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTIFO43310 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTIFO43310 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTIFO43310 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTIFO43310 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTIFO43310 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTIFO43310 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTIFO43310 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTIFO43310 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTIFO43310 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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