Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
PFDN6O15212 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PFDN6O15212 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PFDN6O15212 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms